Отборът е основан през 1919 година под името ФК Габрово. В началото на 1920 преминава към гимнастическо дружество Юнак. В средата на същата година се отделя и става спортен клуб Балкан. Няколко месеца по-късно приема името Ото. На 15 март 1925 година клубът се преименува на Чардафон. Това положение продължава до 1946, когато се обединява със СК Априлов. Една година по-късно всички спортни клубове в града са обединени в ОРПС Априлов. През 1949 година във връзка с реорганизацията на българския спорт на производствен принцип се създават няколко Доброволни спортни организации (ДСО) - Динамо, Червено знаме, Торпедо, Строител, Спартак. След отпадането на ДСО праз 1956 година се създава единен градски отбор под името Балкан. През 1962 година Балкан се разделя на Чардафон и Орловец, като Чардафон си остава представителният отбор на Габрово, а Орловец се състезава в зоналните групи. На 30 януари 1964 година двете дружества се обединяват под името Чардафон-Орловец, а през 1972 година се применува на Янтра. След изваждането си от А група през есента на 1993 година името Чардафон е възтановено. От сезон 2001/02 клубът се нарича Янтра.
Отборът има 7 сезона в А група и 40 - в Б група. Най-доброто постижение постига през сезон 1970/71 когато се класира на осмо място в А група.
Янтра има и едно участие в евротурнирите. През сезон 1993/94 отборът участва в УЕФА Интертото и макар да печели само една точка, самият факт че играе срещу такива отбори е добро постижение.
Група 1:
Рапид (Виена, Австрия) - Янтра (Габрово) 6:0
Янтра (Габрово) - Зависза (Бидгосзцз, Полша) 0:0
Янтра (Габрово) - Халмщад БК (Халмщад, Швеция) 0:1
Брьондби (Копенхаген, Дания) - Янтра (Габрово) 6:4
М П Р З ГР Т
1. Рапид (Виена) 4 3 1 0 14:4 7
2. Зависза (Бидгосзцз) 4 1 2 1 8:4 4
3. Халмщад БК (Халмщад) 4 2 0 2 3:4 4
4. Брьондби (Копенхаген) 4 2 0 2 11:15 4
5. Янтра (Габрово) 4 0 1 3 4:13 1