История Тимът на Евертън е създаден през 1878 година в региона на църквата Сейнт Доминго, това е и първото име на отбора - Сейнт Доминго ФК, което се задържа едва за 12 месеца, след което приема наименованието Евертън. Футболният клуб е създаден с цел хората от местната енория да практикуват спорт и през зимата, тъй като през лятото те са били заети предимно с крикет. През 1888 г. Евертън е един от основателите на Футболната лига в Англия, заедно с Престън, Астън Вила, Уулвърхямптън, Блекбърн Роувърс, Болтън У, Уест Бромич, Акрингтън, Бърнли, Дарби Каунти, Нотс Каунти, Стоук Сити. През първия сезон в лигата Евертън се класира на 8-о мястоа, а първата титла е спечелена още в третия сезон от своето участие във Футболната лига - през сезон 1890-91. Два сезона по-късно, през 1893 клубът достига до своя първи финал в турнира за Купата на Футболната Асоциация (Купата на Англия), но губи с 0:1 от Уулвърхямптън. След четири години Евертън отново е на финал, но отново търпи поражение, този път от Астън Вила с 2:3. За първи път трофеят на Футболната Асоциация е спечелен през 1906, когато на финала е надигран Нюкасъл Юнайтед.
20-те и 30-те години на XX век Първият успешен период на клуба започва от средана 20-те години на миналия век, когато през 1925 г. клубът закупува Уилиъм Ралф Дийн, или както е известен Дикси Дийн. Играч превърнал се впоследаствие в легенда на Евертън. С екипа на сините от Ливърпул Дикси Дийн поставя рекорд в лигата за всички времена по отбелязани голове, 60 гола в 39 мача. Постижение помогнало на клуба да спечели трета титла до момента.
Две години по-късно, непосредствено преди Първата световна война, клубът изпада във Втора дивизия, където се задържа едва един сезон и още от първия си опит успява да се завърне във футболния елит на Англия и още в следващия сезон - 1931-32, Евертън дори става за четвърти път шампион. Само година по-късно тимът печели и втората Купа на ФА, надделявайки на финала на ст. "Уембли" Манчестър Сити с 3:0. Исторически двубой, в който за първи път в света се използват номера на гърба на фланелките на футболистите. Първата успешна ера за клуба завършва през сезон 1938-39, когато Евертън успява да завоюва своята пета шампионска титла.
След Втората световна война следват трудни години, като тимът изпада за втори път в своята история във Втора дивизия, през сезон 1950-51. Периодът на престой там е три години и през 1954-а година Евертън отново се завръща в елитния ешалон, от когато и на когото клубът е неразделна част до днес.
60-те години на XX век Вторият успешен период на клуба започва с назначването за мениджър на Хари Катерик през 1961 г., като още през 1962-63 Евертън отново е шампион на Англия, а само три години по-късно, през 1966-а, печели и за трети път Купата на ФА, побеждавайки на финала Шефилд Уензди с 3:2. Интересен факт от този финал е, че до един момент в мача Шефилд У води с 0:2, но все пак Евертън успява да постигне пълен обрат още в редовното време на двубия. През 60-те години най-изявените имена в отбора са: Алън Бол, Джо Ройъл, Колин Харви, Хауърд Кендал и Брайън Лабоун.
80-те години на XX век Този период се свързва с името на треньора Хауърд Кендъл. Отборът печели две шампионски титли - през 1985 и 1987 г., за да наруши хегемонията на своите съграждани "Ливърпул". Печелят и КНК през същата 1985 г. В момента, когато трябва да се изявят в КЕШ, идва трагедията на "Хейзел" и отборът губи този шанс. В отбора са: Невил Саутол, Кевин Ратклиф (кап.), Гари Стивънс, Кевин Шийди, Питър Рийд, Тревор Стивън, Анди Грей. Разбира се, не може да не се спомене и името на по-късно закупения от "Лестър" Гари Линекър.
Сезон 2007-08 През настоящия сезон Евертън участва за осми път в турнира за Купата на УЕФА, където клубът попадна за първи път в своята история в груповата фаза на турнира. В първия кръг тимът от Мърсисайд преодоля много трудно Металист Харков от Украйна. "Карамелите" попаднаха в една група с Нюрнберг (Германия), АЗ Алкмаар (Холандия), Зенит Ленинград (Русия) и Лариса (Гърция). "Сините" от Ливърпул успяха да излезнат от тежката група като постигнаха победи и в четирите си двубоя: 3:2 като гост на Алкмаар, 1:0 като домакин над Зенит, 2:0 като гост на Нюрнберг и 3:1 срещу Лариса у дома. Предстои 1/16-финален двубой срещу норвежкия Бран Берген, при победа Евертън ще играе срещу победителя от двубоя Розенборг/Фиорентина. В момента Евертън се представя отлично и в треторазрядния турнир в Англия - Купа на Лигата (Карлинг Къп), където тимът вече е на полуфинал. На осминафинала възпитаниците на Дейвид Мойс преодоляха трудно като гости Фулъм с 1:0, след продължения. На четвъртфинала бе победен Уест Хям като гост с 2:1. Във Висшата лига след колеблив старт, Евертън стабилизира своите изяви и в момента тимът се намира на шесто място, само на три точки от четвъртия в класирането - Манчестър Сити. Към 21 декември 2007 г. Евертън е без загуба вече в цели 13 мача поред.